Mario Ancic empezó a jugar al tenis a los siete años. Entrenó con Goran Ivanisevic desde los diez años y adoptó maneras de su compatriota. Después de derrotar a Federe en la pista de Wimbledon en 2002, los medios de comunicación británicos le pusieron el apodo de "Super Mario". Su padre, Stipe, es propietario de una cadena de supermercados; su madre, Nilda, es consejera financiera. Tiene un hermano mayor, Ivica, que viaja y trabaja con él. También tiene una hermana menor, Sanja, que estuvo en el Top 10 del mundo en junior en 2005.
Sus aficiones son leer, el fútbol, el baloncesto, el cine, la música y en general todos los deportes con balón. Fue uno de los mejores tenistas junior del mundo, alcanzando la final de Wimbledon en el 2000 cuando tenía 16 años, donde cayó ante Nicolas Mahut en tres sets. También fue finalista en el Open de Australia y semifinalista en el Open USA Junior, perdiendo ante Roddick en ambos torneos. Terminó en el número 4 del ranking del mundo junior. Es miembro del equipo croata de Copa Davis desde 1999. Su entrenador desde agosto de 2005 es el sueco Fredik Rosengren.
El croata Mario Ancic es uno de los mejores especialistas del mundo cuando se trata de jugar sobre hierba.